DNA uttrycks poetically

Idag, ett verk av molekylärbiologer fokuserar till stor del på en ingen lätt uppgift: att förstå språket genom vilken DNA uttrycks för att bygga den enorma maskineriet i en levande varelse. Publicerad i tidskriften e-Life, en ny studie av ett internationellt team av forskare föreslagit en ny och suggestiv metafor för att belysa de intrikata vägar genomet.

Först av allt, kom ihåg att DNA har i stort sett två typer av regioner, som de kallar experter: protein-kodande och icke-kodande eller reglerande. Medan den förra uttrycks som trafikskyltar med budskap "stopp" och "gå" - regulatoriska sekvenser, förklarar författarna arbetet, skulle de ha mer att göra med poesi.

"Emily Dickinson, Allen Ginsberg Shakespeare eller använda ord att framkalla tankar och känslor, det vill säga att kontrollera eller" vanlig "budskap. När vi går in i en era där DNA-sekvenser av hela befolkningen blir allt mer tillgänglig, vill vi veta den funktionella betydelsen av de förändringar som sker i reglerings sektioner ", förklarar David Arnosti, professor vid State University of Michigan och huvudförfattare till forskningen.

För att nå denna slutsats har forskare studerat genuttryck i tusen embryon av bananfluga, vanligt i sådana experiment. Specifikt, de har undersökt hur en regulatorisk faktor, kallad Dorsal, som styr expressionen av en fluga gen som kallas romboid, och det är också kopplat till en mycket viktig för immunsystemet och inflammatoriska processer vid sjukdomar humana genfunktioner. Målet är att skapa en matematisk modell som sedan kan appliceras på andra icke-kodande sekvenser.

"Genom denna metod kan vi göra något som liknar när en litteratur klass läsa en haiku eller en sonett av Shakespeare för att fastställa om de är kärleksdikter eller elegier, till exempel. -De ord förstå hur DNA- element används i olika sammanhang för att anta olika betydelser i genreglering "tillägger Arnosti.

Målet är att skapa en matematisk modell som sedan kan appliceras på andra icke-kodande sekvenser.

Tolka "poetiska" meddelanden regulatoriska regioner tillåter, till exempel, för att bättre förstå vad som är skillnaderna i genuttryck mellan frisk vävnad från en individ och en som har utvecklat tumör för att ta reda på exakt vad som hände och därmed förfina behandlingar.

Tags

biokemimänskliga genometgenetiskaforskning